Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN4Q92575 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN4Q92575 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms