Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SREK1Q8WXA9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms