Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SELENOMQ8WWX9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SELENOMQ8WWX9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms