Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CKAP2Q8WWK9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CKAP2Q8WWK9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CKAP2Q8WWK9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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