Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMO7Q8WWI1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
LMO7Q8WWI1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMO7Q8WWI1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms