Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATL2Q8NHH9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms