Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYRIPQ8NFW9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MYRIPQ8NFW9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms