Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF548Q8NEK5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF548Q8NEK5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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