Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC197Q8NCU1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms