Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM35BQ8NCS4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM35BQ8NCS4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM35BQ8NCS4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms