Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HJURPQ8NCD3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HJURPQ8NCD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HJURPQ8NCD3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms