Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM1BQ8NB78 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KDM1BQ8NB78 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms