Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POMGNT2Q8NAT1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POMGNT2Q8NAT1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMGNT2Q8NAT1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMGNT2Q8NAT1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMGNT2Q8NAT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POMGNT2Q8NAT1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMGNT2Q8NAT1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMGNT2Q8NAT1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POMGNT2Q8NAT1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms