Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ANKRD53Q8N9V6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ANKRD53Q8N9V6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms