Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RYBPQ8N488 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms