Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPC2Q8N158 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPC2Q8N158 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPC2Q8N158 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms