Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJD3Q8N144 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJD3Q8N144 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms