Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMYD4Q8IYR2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMYD4Q8IYR2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms