Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID3BQ8IVW6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARID3BQ8IVW6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms