Protein–RNA interactions for Protein: Q86WP2

GPBP1, Vasculin, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1Q86WP2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPBP1Q86WP2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPBP1Q86WP2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms