Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HAPLN4Q86UW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HAPLN4Q86UW8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms