Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
NLRX1Q86UT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRX1Q86UT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRX1Q86UT6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms