Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
OTOP3Q7RTS5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OTOP3Q7RTS5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms