Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STRADAQ7RTN6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STRADAQ7RTN6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms