Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
OTOP1Q7RTM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
OTOP1Q7RTM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
OTOP1Q7RTM1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms