Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8DQ7L1W4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8DQ7L1W4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8DQ7L1W4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8DQ7L1W4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8DQ7L1W4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8DQ7L1W4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8DQ7L1W4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms