Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2R2Q712K3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2R2Q712K3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE2R2Q712K3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2R2Q712K3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE2R2Q712K3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE2R2Q712K3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms