Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BBS12Q6ZW61 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BBS12Q6ZW61 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms