Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

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Length 3,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
CFAP47Q6ZTR5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CFAP47Q6ZTR5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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