Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZNF493Q6ZR52 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms