Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBP6Q6ZN66 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GBP6Q6ZN66 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GBP6Q6ZN66 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms