Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CXCL17Q6UXB2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCL17Q6UXB2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms