Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
APOA5Q6Q788 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
APOA5Q6Q788 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms