Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TXNDC11Q6PKC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TXNDC11Q6PKC3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms