Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZCCHC12Q6PEW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms