Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC27A1Q6PCB7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC27A1Q6PCB7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC27A1Q6PCB7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms