Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A3

ZNF549, Zinc finger protein 549, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549Q6P9A3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF549Q6P9A3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF549Q6P9A3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms