Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED27Q6P2C8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED27Q6P2C8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms