Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV7

CDPF1, Cysteine-rich DPF motif domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDPF1Q6NVV7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDPF1Q6NVV7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CDPF1Q6NVV7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms