Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RCSD1Q6JBY9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RCSD1Q6JBY9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RCSD1Q6JBY9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms