Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SDE2Q6IQ49 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms