Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CAPRIN2Q6IMN6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CAPRIN2Q6IMN6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms