Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATL3Q6DD88 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATL3Q6DD88 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATL3Q6DD88 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms