Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CEP135Q66GS9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEP135Q66GS9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms