Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
WSCD1Q658N2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
WSCD1Q658N2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms