Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ALS2CLQ60I27 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ALS2CLQ60I27 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ALS2CLQ60I27 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.9 ms