Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RRAGBQ5VZM2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RRAGBQ5VZM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RRAGBQ5VZM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms