Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
PRAMEF8Q5VWM4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRAMEF8Q5VWM4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms