Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CACHD1Q5VU97 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACHD1Q5VU97 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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