Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LIN9Q5TKA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN9Q5TKA1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LIN9Q5TKA1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms